Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder cookies. Jag förstår

En smartare it-nyhetssajt

Spel-AI för celler

Stamceller I 3D

En AI-baserad teknik för att analysera sociala nätverk har fått betydelse för individanpassad vård och framtidens läkemedel. Det är forskare vid Uppsala universitet som sett möjligheterna med den avancerade bildanalystekniken för att hantera viktig information som andra metoder missar.

– Vi utnyttjar de senaste metoderna inom AI, eller mer specifikt grafbaserade neurala nätverk som utvecklats för att analysera sociala nätverk och anpassar dem för att förstå biologiska mönster och gradvisa variationer i vävnadsprover, säger Carolina Wählby, professor vid institutionen för informationsteknologi vid Uppsala universitet.

– Man kan likna cellerna vid sociala enheter som liksom grupper av individer kan definieras utifrån de aktiviteter de delar inom sina sociala nätverk som till exempel Twitter, sökningar på Google eller val av tv-serier.

Kort om celler

Vävnaden som bygger upp våra organ består av biljoner celler med olika funktion. Alla celler hos en individ har samma gener, DNA, som finns i cellkärnan.

Generna uttrycks genom att molekyler kallade budbärar-RNA med information om vad som ska göras skickas ut från cellkärnan till resten av cellen. Kombinationen av mRNA definierar på så sätt cellens arbetsuppgifter i kroppen.

RNA kan avläsas med hjälp så kallad in situ-sekvensering, där miljontals avlästa mRNA syns som prickar i en mikroskopibild av vävnaden. Det är en svår utmaning att urskilja alla viktiga detaljer.

Källa: Uppsala universitet

Algoritmer ser mer

Forskare vid Uppsala universitet har utvecklat en ny bildanalysmetod för att lära mer om kroppens celler och vävnad. Den avancerade tekniken är baserad på AI-algoritmer som från början togs fram för att förstå sociala nätverk. Metoden kan läsa av enorma mängder information om såväl funktioner inom en enskild cell och interaktioner mellan celler.

Tidigare analysmetoder är beroende av att det redan är känt vilka celltyper som finns i vävnaden och att cellkärnorna i den är identifierade. Det kan också vara svårt att hitta de olika cellkärnorna om till exempel cellerna ligger tätt.

– Med vår analys som vi kallar spage2vec kan vi nu få fram motsvarande resultat utan någon förkunskap om förväntade celltyper och kan dessutom hitta nya celltyper och funktioner inom eller mellan celler i vävnaden, säger Carolina Wählby.

Hjärtats utveckling

Forskargruppen arbetar nu vidare med sin analysmetod genom att undersöka hur olika celltyper uppstår och organiserar sig under hjärtats tidiga utveckling. Det är ren grundforskning som syftar till att öka kunskapen om dessa mekanismer, både när allt fungerar som det ska och vid sjukdom.

Det finns också förhoppningar om att kunna använda analysmetoden för att bättre förstå cancer. Målet är att det på sikt ska kunna leda till bättre behandlingar som anpassas efter varje patient.

Källa: Uppsala universitet

2 november 2020 Reporter anne hammarskjöld digit Foto adobestock

Senaste nytt

Ny look i Outlook

4 mars 2021

Outlook får ett nytt utseende som ska göra det lättare att organisera och planera. Dessutom kommer en ny automatiserad mötesbokare.

Nya språk för Webex

3 mars 2021

Cisco inför ett utökat språkstöd i Webex. Det innebär översättning i realtid för drygt 100 språk, bland annat svenska och övriga nordiska språk.

El för Volvo 2030

2 mars 2021

Om mindre än ett decennium ska alla Volvo Cars bilar vara helt eldrivna. Samtidigt kommer försäljningen nästan uteslutande ske online.  

Digitala nationella prov försenas

2 mars 2021

Plattformen som de digitala nationella proven ska ligga på uppfyller inte de juridiska kraven för skydd av personuppgifter. Nu skjuts därför både proven och testverksamheten upp.

MS anpassar moln

1 mars 2021

Microsoft lanserar fler molntjänster anpassade till olika branscher. Nya områden är bland annat bank och finans och industri.

Digital brottskarta

1 mars 2021

Region Stockholm lanserar en karta över anmälda brott. Syftet är att ge polis och övriga i samhället bättre koll och att skadegörelse, droger och inbrott ska minska.